Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms