Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MAPK10-204ENST00000395157 2665 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 UBQLNL-201ENST00000380184 2313 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MAPK10-290ENST00000641237 2826 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ETS1-204ENST00000526145 3389 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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CLN3Q13286 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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CLN3Q13286 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SUMO2P17-201ENST00000504438 285 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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CLN3Q13286 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ABCB4-203ENST00000359206 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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