Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LACTB2-AS1-201ENST00000499227 3716 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 DCAF8-203ENST00000368074 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ZNF781-201ENST00000358582 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CYB5D1-201ENST00000332439 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 TMEM144-201ENST00000296529 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 DGKG-202ENST00000344484 3445 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RPL10P19-201ENST00000519013 301 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL049833.3-201ENST00000623920 3738 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MPI-213ENST00000566377 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LCA5-201ENST00000369846 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CEP41-219ENST00000616628 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MFSD8-207ENST00000513559 1813 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PREPL-204ENST00000409272 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SERPINA9-203ENST00000380365 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RPS3P7-201ENST00000488662 726 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AP005210.1-201ENST00000583659 544 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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