Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ANKS1B-213ENST00000549025 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 TYW5-201ENST00000354611 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 ZNF185-202ENST00000318529 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 LRRC8D-202ENST00000394593 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 ACSM4-201ENST00000399422 2142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 BTN2A2-202ENST00000356709 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 OR7A17-203ENST00000642123 3565 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 FAM83F-201ENST00000333407 15561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 ARHGAP5-204ENST00000432921 5003 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 RCBTB1-202ENST00000378302 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 PABPC3-201ENST00000281589 3387 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 LRRC7-201ENST00000035383 5000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 CDHR3-211ENST00000478080 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 AMER1-201ENST00000330258 8443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC006455.4-201ENST00000418297 528 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC073188.4-201ENST00000450077 528 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 IGHV3-54-201ENST00000622166 353 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 IPO7P2-201ENST00000451446 1750 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 FOXR2-201ENST00000339140 1926 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 GSDMC-201ENST00000276708 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 KIF23-201ENST00000260363 3713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRHP20396 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRHP20396 YME1L1-203ENST00000376016 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRHP20396 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRHP20396 SERPIND1-201ENST00000215727 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRHP20396 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC008498.2-201ENST00000624033 2322 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TRHP20396 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRHP20396 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms