Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms