Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC005262.1-201ENST00000588562 362 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 MIR6083-201ENST00000612737 106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 BX510359.8-201ENST00000617713 296 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 FAM238A-202ENST00000637359 442 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 ZNF641-202ENST00000448928 1856 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 EIF4G3-202ENST00000356916 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 FP325330.3-201ENST00000623760 9537 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 CAV1-201ENST00000341049 2704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 KAT6A-208ENST00000485568 3592 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 ZNF322-202ENST00000456172 4718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 ZNF322-207ENST00000607204 4737 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 NLRP1-210ENST00000572272 4422 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC079174.2-201ENST00000611145 2028 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC021491.4-201ENST00000620769 2573 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 PRKAR1A-211ENST00000586397 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 FIGNL1-214ENST00000617389 3259 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 FHL2-207ENST00000409177 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 CLDN2-201ENST00000336803 2959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 LINC00954-202ENST00000449086 2995 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 ARL11-201ENST00000282026 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AL022323.3-201ENST00000623888 5388 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 CTNNA1-243ENST00000540387 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 UNC5C-201ENST00000453304 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 SYT2-202ENST00000367268 7598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 ZNF880-201ENST00000344085 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 SNORA7.3-201ENST00000384186 139 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 MED15P4-201ENST00000417579 393 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 RNF7P1-201ENST00000478598 342 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 KRTAP9-12P-201ENST00000514388 532 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC023232.1-201ENST00000524963 285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC074032.1-202ENST00000552815 467 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 RN7SL711P-201ENST00000579731 299 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC026458.2-201ENST00000589323 531 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 MELK-206ENST00000536329 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 ABLIM3-205ENST00000504238 2774 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 NDUFB5-214ENST00000493866 4046 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 KLHL1-202ENST00000545028 3966 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 AC016909.2-201ENST00000424510 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 SIRPB1-213ENST00000568365 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 TCF7-202ENST00000378560 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 RAB3IP-218ENST00000553099 2674 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 IL2RB-201ENST00000216223 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CACNB1Q02641 XIRP2-205ENST00000409605 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 CR786580.1-201ENST00000417843 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 LINC01410-201ENST00000424345 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL353583.1-201ENST00000624195 1855 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 CSF3R-203ENST00000373103 3454 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 STK36-201ENST00000295709 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 FAM13C-217ENST00000618804 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ZNF763-201ENST00000343949 2621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AJUBA-203ENST00000397388 2648 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SKAP1-201ENST00000336915 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.5-201ENST00000356560 281 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SNRPCP1-201ENST00000433292 458 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RPL23P4-201ENST00000442836 416 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms