Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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