Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSAG1Q6PB30 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms