Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EIF4EBP1Q13541 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
EIF4EBP1Q13541 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms