Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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