Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF3C6Q969F1 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms