Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms