Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CORIN-208ENST00000508498 3200 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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SH3BP2P78314 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SH3BP2P78314 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC126755.2-209ENST00000531453 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SH3BP2P78314 AC138969.1-212ENST00000541593 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 NPIPA5-203ENST00000543801 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SH3BP2P78314 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SH3BP2P78314 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SH3BP2P78314 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SH3BP2P78314 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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