Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RN7SL472P-201ENST00000492799 293 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 EGFLAM-207ENST00000506135 889 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MIR2052HG-204ENST00000523442 550 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC087164.1-201ENST00000577847 513 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC006115.3-201ENST00000594400 560 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 C22orf24-203ENST00000623735 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 NWD1-205ENST00000549814 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ATP7B-204ENST00000400370 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 TROVE2-204ENST00000367445 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC008060.4-201ENST00000569431 1861 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MUC3A-201ENST00000379458 11226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 UPF3B-201ENST00000276201 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 NEMP1-202ENST00000379391 5370 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RSBN1L-203ENST00000445288 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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HOXD11P31277 SP100-202ENST00000340126 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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HOXD11P31277 TUBB-207ENST00000396384 2823 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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HOXD11P31277 ARMC8-223ENST00000538260 4728 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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HOXD11P31277 NCAM1-201ENST00000316851 5837 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PTPRA-203ENST00000356147 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ZBTB10-201ENST00000379091 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 BICC1-201ENST00000263103 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 TMEM51-AS1-201ENST00000310916 7100 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ODF2-203ENST00000372807 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 FGF5-203ENST00000456523 5234 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MRPS18B-206ENST00000259873 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PARL-212ENST00000639100 1513 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CACNA1E-201ENST00000357570 7064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 SRSF10-203ENST00000343255 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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