Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009779.3-202ENST00000550412 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC17A6-201ENST00000263160 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMAT3-201ENST00000311417 9406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP9P1-201ENST00000540920 2655 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CTAGE5-214ENST00000556148 2526 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2C2-202ENST00000416219 3472 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOSC2-211ENST00000546165 1956 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MEIS2-206ENST00000424352 2917 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NVL-216ENST00000482491 3003 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 C20orf173-201ENST00000246199 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDOAP2-201ENST00000398050 1076 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PGAM1P2-201ENST00000436071 725 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS10P3-201ENST00000439253 494 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL833P-201ENST00000498758 284 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG1L14P-201ENST00000514230 434 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091144.2-201ENST00000521717 433 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2D-14-201ENST00000522473 355 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NT5CP1-201ENST00000554092 509 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104984.4-201ENST00000577420 224 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.5 ms