Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TM4SF4P48230 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TM4SF4P48230 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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TM4SF4P48230 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TM4SF4P48230 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TM4SF4P48230 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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