Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms