Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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USP35Q9P2H5 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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USP35Q9P2H5 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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USP35Q9P2H5 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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USP35Q9P2H5 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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USP35Q9P2H5 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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