Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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UBE2OQ9C0C9 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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UBE2OQ9C0C9 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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UBE2OQ9C0C9 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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UBE2OQ9C0C9 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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UBE2OQ9C0C9 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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UBE2OQ9C0C9 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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UBE2OQ9C0C9 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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UBE2OQ9C0C9 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE2OQ9C0C9 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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