Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-214ENST00000434208 4055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CDRT1-203ENST00000395667 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB15-201ENST00000275699 2706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CIZ1-201ENST00000277465 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PHTF2-203ENST00000307305 4793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031666.2-201ENST00000599904 2253 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMTC4-201ENST00000328767 2101 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CLUAP1-212ENST00000576634 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IL18R1-203ENST00000409599 3854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ST13-201ENST00000216218 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 STRIP1-202ENST00000369796 3125 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LL22NC03-63E9.3-201ENST00000407120 3111 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTNAP3B-211ENST00000612828 7455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 WDPCP-201ENST00000272321 3392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX9-201ENST00000245479 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RHOH-201ENST00000381799 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP5-204ENST00000432921 5003 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH26-202ENST00000348616 3182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TTK-208ENST00000509894 3725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TSC22D3-206ENST00000372397 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB29-202ENST00000367139 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM126A-202ENST00000409923 3130 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.4 ms