Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD12P35452 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD12P35452 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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