Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms