Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1C-215ENST00000399637 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1C-221ENST00000402845 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 DLG3-210ENST00000542398 4529 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 C5orf66-AS2-201ENST00000505663 2162 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ADGRE3-202ENST00000344373 2267 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM107-208ENST00000532998 2358 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 EZH1-205ENST00000585893 2394 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 DNM3-206ENST00000520906 4454 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 MME-212ENST00000493237 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 M6PR-201ENST00000000412 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF226-215ENST00000590089 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 SERPINB9-201ENST00000380698 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 AC027801.2-201ENST00000515692 1816 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 AASS-203ENST00000417368 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF438-205ENST00000436087 3164 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM177A1-203ENST00000396472 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 TSC22D3-206ENST00000372397 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 GRHL3-202ENST00000350501 2119 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 AKAP1-219ENST00000621116 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF16-201ENST00000276816 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC2A14-215ENST00000542546 3120 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 LPAR3-202ENST00000440886 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM13C-217ENST00000618804 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 C12orf57-201ENST00000229281 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 PRM3-201ENST00000327157 424 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 MYL9-202ENST00000346786 1024 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 RN7SKP134-201ENST00000363960 269 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 RNA5S9-201ENST00000364451 119 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-2Q9BYR5 KRTAP20-3-201ENST00000382826 273 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.9 ms