Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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IFT88Q13099 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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IFT88Q13099 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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IFT88Q13099 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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