Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX49Q9Y6V7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms