Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms