Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNPO3Q9Y5L0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms