Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms