Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms