Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFE2L3Q9Y4A8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2L3Q9Y4A8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms