Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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HCN4Q9Y3Q4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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HCN4Q9Y3Q4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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HCN4Q9Y3Q4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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HCN4Q9Y3Q4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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HCN4Q9Y3Q4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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HCN4Q9Y3Q4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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HCN4Q9Y3Q4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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HCN4Q9Y3Q4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN4Q9Y3Q4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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