Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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