Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRELID3BQ9Y3B1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms