Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms