Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM2AQ9Y2K7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM2AQ9Y2K7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms