Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms