Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms