Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYO6Q9UM54 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms