Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms