Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMCC3Q9ULS5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms