Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNMA8BQ9ULN7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNMA8BQ9ULN7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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