Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms