Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA4Q9UI42 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms