Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NPC1L1Q9UHC9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms