Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms