Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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