Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD2Q9UBB5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms