Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms