Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC88CQ9P219 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms