Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms